保护自然与和平而行动的“口袋妖怪守护者”，他们与口袋妖怪一起解决自然灾害和村民们的烦恼。主人公可以从男孩和女孩中进行选择。主人公是一名学生，为了成为憧憬中的口袋妖怪守护者，在训练学校中磨练技能。

　　阻挡主人公去路的是妨碍通行的“岩石”和“断树”。这些障碍物，需要借用捕捉的口袋妖怪们的力量来清除。在冒険中遇到无法前进的情况，就积极借助同伴口袋妖怪的力量吧。